导致孩子大脑发育迟缓的原因很多，可以分为遗传因素及非遗传因素。遗传因素包括染色体或基因异常导致的遗传疾病，如唐氏综合征、氨基酸代谢病、脂类代谢病、糖类代谢病等，都可以导致孩子大脑发育迟缓。

非遗传因素包括宫内感染，比如巨细胞病毒、风疹病毒等感染导致患儿大脑损害。

分娩过程中的缺氧、缺血、颅内出血等导致大脑损害，以及宝宝早期成长过程中颅脑外伤、脑膜炎、脑炎等疾病，都可以导致大脑发育迟缓的情况出现。