替硝唑氯化钠注射液用来治疗各种类型的厌氧菌感染，比如牙龈炎、口腔炎、腹膜炎、盆腔附件炎、伪膜性结肠炎等，还经常用来预防结直肠手术、胃肠手术及妇科手术后各种厌氧菌感染。

虽然现在三代和四代头孢菌素类药物也已经覆盖了厌氧菌感染的治疗，但因为本药对厌氧菌感染疗效好、治疗费用低，所以临床上应用还是非常广泛的。

使用本药的时候可能会有恶心、呕吐、上腹痛、食欲下降以及口腔金属味等副作用，但一般比较轻微，不影响治疗。怀孕3个月内、12岁以下儿童、哺乳期的女性不要使用本药，用药期间和停药一周内不能喝酒。