输尿管结石、膀胱结石、尿道结石、尿道炎、膀胱炎、男性的前列腺炎等疾病，都有可能会引起尿疼。

输尿管下段结石除引起腰痛外，结石还会刺激膀胱及尿道，可能会出现尿痛的情况。膀胱结石会堵塞尿道内口，出现排尿中断及排尿疼痛。尿道结石卡在尿道会出现尿疼及排尿困难等症状。当患有膀胱炎或者尿道炎，病原体刺激膀胱黏膜，或者尿道黏膜末梢神经，可能出现尿频、尿急、尿疼等症状。

男性患有前列腺炎、前列腺包膜张力增大，有时会出现尿疼、会阴部坠胀不适、尿后滴白的情况。