怀孕20天不可以进行药物流产。

因为在怀孕20天时孕囊并没有形成，无法确定是宫内怀孕还是宫外孕。要想进行药物流产，应当在怀孕后的6周就医进行检查，首先应当确定是宫内孕，并且孕妇的年龄在40岁以下，也没有一些药物流产的禁忌证才可以进行药物流产。因此在怀孕20天时不应进行药物流产。

在进行完药物流产以后，阴道内也会出现短暂性的出血，如果出血时间较久，应就医进行B超检测，明确子宫内是否有残留的组织，必要时需要进行清宫手术。