克罗恩病和矮小症有很大的关系，因为克罗恩病有可能是矮小症的诱因。

克罗恩病是属于一种肠道的疾病，会影响到营养的吸收，所以导致小儿发育异常。当克罗恩病发展严重的时候，会影响到小肠不能吸收食物当中的营养，当小肠受损严重时，还不能够正常的吸收维生素D，所以影响到了对钙物质的吸收，阻碍了骨骼的发育。

所以患有克罗恩病的儿童，可能比正常的孩子更矮、体重更轻。甚至严重的儿童，可能会停止发育，目前可能没有比较好的治疗方式。