肛周脓肿分为非瘘管性脓肿和瘘管性脓肿，非瘘管性脓肿是指脓腔不与肛内相通，肛内没有内口。瘘管性脓肿是指脓腔与肛内相通，肛内存在内口。

因非瘘管性脓肿不与肛内相通，不需要处理内口，所以在脓肿破溃后，只要将脓腔扩大清创以方便引流，很快就会愈合而且不会复发。

瘘管性脓肿因肛内存在内口，如果不将内口处理好会，内口处就会反复发生感染，即使外面的脓腔及瘘管已完全愈合，因内口感染还会再次复发，所以瘘管性脓肿的脓腔即使自行破溃流脓，也需要进行手术处理内口，这样才不会导致疾病的复发。