新生儿是有可能出现先天性直肠闭锁的。

先天性肛门直肠闭锁是一种较常见的消化道畸形，是发病率最高的消化道畸形性疾病，通常是因为胚胎时期消化道发育异常所致。具体的发病机制尚不完全明确，可能与遗传因素、有毒及放射物质的刺激等有关，查体时会发现会阴部平坦无肛门，有的还可以伴有膀胱和生殖器瘘。

先天性肛门直肠闭锁的新生儿出生24小时内无胎粪排出，并且逐渐出现腹痛、腹胀、恶心、呕吐等肠梗阻症状，因此一旦确诊后，要尽早手术治疗。