药流后腰疼、肚子疼可能是正常现象，因为在服用药物以后通常会促进子宫收缩，就会引起腰疼、肚子疼的症状。通常疼痛不太严重，3~5天后腰疼、肚子疼的症状会自行消失。

如果药流以后腰疼、肚子疼的症状比较严重，并且阴道出血不止，要警惕为流产不全，需要就医进行B超检查。如果发现孕囊没有排出，必要时进行清宫手术。

如果在药物流产以后没有做好护理，可能会导致宫腔内感染，感染加重以后就会导致腰疼、肚子疼，确诊后应及时进行抗感染治疗。