脑血栓手术风险大不大，这主要和血块程度以及和大脑缺氧的程度，和脑损伤的程度等多方面有关。最好先进行相关检查，然后通过风险评估，及时针对治疗。对于脑血栓手术风险是不确定的，所以在早期应该及时治疗，降低风险性。

脑血栓如果是通过介入治疗，相对风险性会比较小一些。但如果需要选择骨瓣减压手术治疗，这种手术风险比较大，而且预后不佳。这种手术主要适合于大面积脑梗死的患者。

具体选择什么治疗方法，还要根据患者的身体检查来进行判断。所以应尽早检查，尽早治疗，在专业医生的指导下选择合适的治疗方案。