六味地黄丸的主要功效和作用是滋阴补肾，因此，凡属于阳虚体质的患者不适合服用。还有经常感觉咳痰胸闷、舌苔黄腻、肢体沉重、酸痛乏力的痰湿体质患者，也不宜服用六味地黄丸。

也有的患者虽然有肾阴虚症状，但是却同时存在脾胃虚寒时，也应慎用和忌用本品。如得病之后出现腹泻、阳痿、寒症的患者，应在医师指导下用药。

另外，有些患者在服用六味地黄丸后，可能偶见一些不良反应，比如头晕加重、肠胃不适、有皮肤出现荨麻疹反应时，如果出现这类不良症状时，应及时停药。