附睾炎的治疗主要依靠抗生素药物，针对细菌感染引起的炎症需选用敏感抗生素，如头孢类、喹诺酮类或大环内酯类药物。急性期可配合非甾体抗炎药缓解疼痛与肿胀，慢性病例可能需要更长的疗程或联合用药。具体药物选择需根据病原体检测结果和患者个体情况，由医生综合判断后开具处方。
附睾炎的药物治疗需明确感染类型。细菌性附睾炎最常见，通常由大肠杆菌、淋球菌或衣原体等引起，首选头孢曲松、左氧氟沙星或多西环素等广谱抗生素。若伴随尿路感染，需同步治疗。疼痛明显时可短期使用布洛芬或对乙酰氨基酚，但需避免掩盖病情进展。对于反复发作或耐药病例，可能需进行药敏试验调整方案。结核性附睾炎需规范抗结核治疗，疗程长达6-9个月。部分患者伴随发热或全身症状，需静脉给药后再转为口服。
使用抗生素必须足量足疗程，擅自停药易导致病情反复或转为慢性。喹诺酮类药物禁用于18岁以下青少年，头孢类药物需警惕过敏反应。治疗期间应禁酒、避免辛辣食物，暂停性活动以减少局部刺激。若48小时内症状无改善或出现高热、脓肿，需立即复诊评估是否需手术引流。慢性附睾炎可能合并精子运输障碍，长期未愈者应定期复查生育功能。所有药物均需在医生指导下使用，避免自行购药或滥用止痛药掩盖病情。
