HPV疫苗主要用于预防而非治疗。目前上市的HPV疫苗通过激发免疫系统产生抗体，从而预防特定型别HPV感染，但无法清除已存在的病毒感染或治疗相关疾病。疫苗的保护作用集中在感染发生前，对已形成的病变无治疗价值。
HPV疫苗的预防效果已得到广泛验证。临床接种后对宫颈癌、生殖器疣等HPV相关疾病的预防效率可达90%以上，尤其是对未暴露于HPV的群体效果更显著。疫苗针对的型别包括高危型如16/18型和低危型如6/11型，覆盖了约70%的宫颈癌病因。但需注意，疫苗无法覆盖所有HPV型别，接种后仍需定期进行宫颈癌筛查。已感染HPV的人群接种疫苗虽不能治疗现有感染，但可预防其他型别HPV的感染。
接种HPV疫苗需结合个体情况。推荐9-45岁女性及男性接种，最佳接种时间为首次性行为前。孕妇、急性病患者及对疫苗成分过敏者应暂缓或避免接种。常见不良反应包括注射部位疼痛、发热等，通常短期内自行缓解。即使完成全程接种，仍需保持安全性行为并配合常规筛查，因疫苗不能替代其他防护措施。医疗决策应咨询专业医生，根据年龄、健康状况及流行病学建议综合判断。
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