眼睫毛根部长小水泡可能是毛囊炎、麦粒肿、过敏反应、感染或皮脂腺囊肿引起，建议保持眼部清洁、避免挤压、使用热敷、及时就医、避免使用刺激性化妆品。具体分析如下：
1.毛囊炎：毛囊炎是毛囊及其周围组织的炎症，常见于眼睫毛根部。症状包括红肿、疼痛和小水泡。保持眼部清洁是关键，避免使用刺激性化妆品。热敷可以缓解症状，促进炎症消退。如果症状持续或加重，应及时就医，医生可能会开具抗生素药膏或口服药物。
2.麦粒肿：麦粒肿是眼睑腺体的急性化脓性炎症，常表现为眼睑边缘的红肿和小水泡。热敷是有效的治疗方法，可以促进脓液排出。避免挤压或自行挑破，以免引起感染扩散。如果症状严重或反复发作，建议就医，医生可能会进行切开排脓或开具抗生素治疗。
3.过敏反应：眼睫毛根部的小水泡可能是对某些化妆品、护肤品或环境因素的过敏反应。立即停止使用可能引起过敏的产品，并保持眼部清洁。冷敷可以缓解瘙痒和肿胀。如果症状严重或持续，建议就医，医生可能会开具抗过敏药物或眼药水。
4.感染：细菌或病毒感染可能导致眼睫毛根部出现小水泡。保持眼部清洁，避免用手触摸或揉搓眼睛。使用医生开具的抗生素或抗病毒药物进行治疗。如果症状加重或伴有发热等全身症状，应及时就医，以免引起更严重的并发症。
5.皮脂腺囊肿：皮脂腺囊肿是皮脂腺导管堵塞引起的良性肿块，可能表现为眼睫毛根部的小水泡。保持眼部清洁，避免挤压或自行处理。如果囊肿增大或引起不适，建议就医，医生可能会进行手术切除或开具药物治疗。
眼睫毛根部的小水泡虽然常见，但病因多样，处理方法也因具体情况而异。保持眼部清洁和避免刺激是基础，热敷和冷敷可以缓解症状。如果症状持续或加重，应及时就医，以免延误治疗。
