巴戟天可能导致过敏反应，但发生率相对较低。作为中药材，巴戟天含有多种活性成分，部分人群可能对其中的某些成分产生免疫系统异常反应，引发过敏症状。临床观察显示，过敏体质者或对植物成分敏感的人群更易出现此类情况。
巴戟天的主要致敏物质可能与其中的多糖、苷类或挥发性成分有关。过敏反应通常表现为皮肤瘙痒、红疹、局部肿胀等轻度症状，严重时可能出现呼吸困难、喉头水肿等全身性过敏反应。部分患者在服用巴戟天制剂后出现消化道不适，如恶心、腹泻等症状，这类反应可能与过敏或药物不耐受有关。现代药理巴戟天中的某些成分可能刺激肥大细胞释放组胺，从而诱发过敏反应。长期使用或过量服用可能增加致敏风险，尤其对于既往有药物过敏史的患者需格外谨慎。
使用巴戟天前建议进行过敏测试，可取少量药物涂抹于前臂皮肤观察反应。初次服用时应从小剂量开始，并密切观察身体反应。避免与其他可能引起过敏的中药材同时使用，如已知对茜草科植物过敏者应禁用。出现过敏症状后需立即停用，必要时服用抗组胺药物或就医治疗。孕妇、哺乳期妇女及儿童等特殊人群使用前应咨询中医师。需注意市售巴戟天可能存在硫磺熏蒸等加工方式，此类化学残留也可能成为致敏因素，建议选择正规渠道购买经过检测的产品。
