某些疾病患者需避免食用芥菜，例如甲状腺功能减退、肾结石、胃肠炎等患者。芥菜含有硫代葡萄糖苷和草酸等成分，可能干扰甲状腺激素合成或加重结石形成，其粗纤维也可能刺激发炎的消化道黏膜。
甲状腺功能减退患者需注意芥菜中的硫苷类物质，这类成分可能抑制碘的吸收，进一步影响甲状腺功能。对于肾结石患者，芥菜中较高含量的草酸可能增加尿液中草酸盐浓度，促进结石形成或增大。胃肠炎或消化性溃疡患者在急性发作期应忌口芥菜，其辛辣味和粗纤维可能加重黏膜损伤，引发疼痛或出血。部分体质敏感者可能对芥菜中的光敏物质过敏，食用后暴露于阳光下易出现皮肤红斑。
食用芥菜前应结合自身健康状况评估风险。甲状腺疾病患者需严格控制摄入量，避免与抗甲状腺药物同服。肾结石患者应减少高草酸食物摄入，同时增加饮水量以降低风险。消化系统疾病患者可选择嫩叶部分，充分烹煮软化纤维。过敏体质者初次尝试需观察皮肤反应，避免日晒。特殊人群如孕妇、儿童建议咨询医生，确保饮食安全。
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