使君子在常规使用情况下不会对肝肾造成明显损害，但过量或长期不当使用可能带来潜在风险。作为一味传统中药，使君子的安全性在合理剂量和正确用法下已得到验证，但任何药物均需警惕不良反应，尤其对肝肾功能异常者需谨慎评估。
使君子的主要活性成分为使君子酸钾，具有驱虫、消积的功效，临床常用于小儿蛔虫病治疗。现代药理治疗剂量下的使君子对肝肾影响较小，其代谢产物主要通过尿液排泄。但动物实验显示，超大剂量超过临床用量5倍以上连续给药时，可能引起实验动物肝细胞轻度水肿和肾小管上皮细胞空泡变性。这种剂量依赖性毒性提示，严格遵循药典推荐剂量成人每日不超过9克是关键。肝功能不全者因代谢能力下降，可能增加药物蓄积风险；肾功能减退者则需注意排泄延缓导致的潜在影响。
使用使君子时需注意以下事项：避免与肝毒性药物联用，服药期间定期监测肝肾功能指标；儿童、老年人及慢性病患者应在医师指导下减量使用；出现食欲减退、尿色加深等疑似肝损伤症状时立即停药就医。传统用法建议使君子仁需炒制后使用，生品可能增加胃肠道刺激。妊娠期妇女及哺乳期女性安全性数据不足，应禁用。储存时需防潮防霉变，霉变产物可能增强毒性。临床用药需辨证施治，非寄生虫感染导致的积滞症状不宜滥用。
