莫西沙星对支原体感染具有一定治疗效果，尤其针对耐药性较强的肺炎支原体。作为第四代喹诺酮类抗生素，其抗菌谱覆盖非典型病原体，包括支原体、衣原体和军团菌。莫西沙星通过抑制DNA旋转酶和拓扑异构酶Ⅳ，有效阻断支原体DNA复制，体外药敏试验中最小抑菌浓度MIC通常低于其他喹诺酮类药物。
支原体感染常见于呼吸道和泌尿生殖系统，传统大环内酯类药物如阿奇霉素曾为首选。但随着大环内酯耐药率上升，莫西沙星成为重要替代选择。该药物组织穿透性强，在肺组织和泌尿道的浓度可达血浆浓度的数倍，适合治疗肺炎支原体肺炎或泌尿生殖道支原体感染。疗程通常为7-14天，症状缓解较快，但需完成全程治疗以避免复发。部分研究指出，莫西沙星对解脲支原体的敏感性略低于肺炎支原体，临床使用前建议进行药敏检测。
使用莫西沙星需警惕不良反应，常见包括胃肠道不适、头晕及光敏反应。喹诺酮类药物可能引起QT间期延长，禁用于心律失常患者。妊娠期、哺乳期及18岁以下青少年避免使用，以免影响软骨发育。与含铝、镁的抗酸剂同服会降低吸收率，需间隔2小时以上。长期使用可能诱发二重感染或耐药性，故不推荐作为一线药物广泛使用。肝功能不全者需调整剂量，用药期间应监测心电图和肝肾功能。
