中医穴位理论在科学层面存在一定依据，但尚未被现代医学完全验证。部分研究显示穴位与神经、血管、淋巴等解剖结构存在关联，但整体机制仍需进一步探索。
现代科学对穴位的研究主要集中在神经生理学和生物电现象领域。通过功能性核磁共振等技术，发现刺激特定穴位可激活大脑相应功能区，如足三里穴与疼痛调节相关脑区存在联系。部分穴位位于神经密集区域，如合谷穴分布有桡神经分支，其镇痛效应可能与神经递质释放有关。皮肤电阻检测显示穴位区域导电性较高，可能与结缔组织中的离子通道相关。经络系统的物质基础尚未明确，现有证据多支持穴位作为功能点而非独立解剖结构。
理解穴位科学依据时需注意几点，现有研究多集中于单一穴位或局部机制，整体经络理论仍缺乏系统性验证；部分实验样本量较小或存在方法学争议；中医穴位理论与现代医学体系存在范式差异，不宜简单对立或等同。临床应用中，穴位刺激疗效已获部分循证医学支持，但作用机制解释需结合多学科研究进展。科学探索与传统理论需保持开放对话，避免绝对化结论。
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