CT检查对胎儿存在潜在风险，尤其在妊娠早期应尽量避免。CT扫描使用的X射线属于电离辐射，可能对发育中的胚胎或胎儿造成不良影响，如增加先天畸形、生长受限或儿童期癌症的风险。虽然单次诊断性CT的辐射剂量通常较低，但胎儿对辐射的敏感性较高，尤其在器官形成的关键期妊娠8-15周风险更为显著。
CT对胎儿的影响取决于辐射剂量、照射部位及妊娠阶段。头部或四肢CT的散射辐射对胎儿影响较小，而腹部或盆腔CT则直接使胎儿暴露于辐射场中。据研究，胎儿接受50mGy以下的辐射剂量时，风险增加不明显，但超过100mGy可能引发严重后果。实际检查中，腹部CT的胎儿辐射剂量约为10-50mGy，而盆腔CT可能更高。医疗人员会权衡检查的必要性，若必须进行，会采用低剂量协议或屏蔽措施减少辐射。
孕妇需谨慎对待CT检查。妊娠期间应主动告知医生怀孕状态，避免非必要的影像学检查。若因紧急情况如严重创伤或疑似肺栓塞必须做CT，需由放射科医生评估风险收益比，优先选择无辐射的替代方案如超声或MRI。检查中可使用铅防护毯遮盖腹部，但需注意散射辐射无法完全屏蔽。计划怀孕或早孕女性也应避免盆腔CT，必要时建议推迟检查或采取避孕措施。任何已接受CT检查的孕妇应咨询产科医生，进行个性化风险评估和监测。
