自身免疫性脑炎自免脑的恢复时间因人而异，部分患者在积极治疗后在6-12个月症状明显改善，少数重症或治疗不及时的病例可能遗留长期认知或运动功能障碍。早期诊断和规范治疗是影响预后的关键因素，多数患者通过免疫治疗可逐步恢复日常生活能力。
自免脑的恢复过程与病因、病情严重程度及个体差异密切相关。急性期通过糖皮质激素、静脉免疫球蛋白或血浆置换等治疗可控制炎症反应，症状缓解后仍需持续免疫抑制治疗数月以防复发。神经功能恢复通常滞后于炎症控制，记忆减退、情绪障碍等症状可能持续较长时间，需结合康复训练和心理干预。部分患者可能出现癫痫发作等后遗症，需长期药物管理。约60%-70%的患者在1-2年内可恢复至接近发病前状态，但少数病例需更长时间。
注意事项包括严格遵循医嘱调整免疫抑制剂剂量，避免自行减药导致复发。定期复查脑脊液抗体滴度及脑影像学评估病情。康复期需保证营养均衡，避免感染诱发免疫紊乱。若出现头痛、精神行为异常等复发征兆需立即就医。部分患者需长期服用抗癫痫药物，需监测药物副作用。心理支持至关重要，家属应协助患者适应认知功能变化，避免过度劳累或精神刺激。疫苗接种需咨询专科医生，部分活疫苗可能需暂缓接种。
