疱疹性咽峡炎和手足口病的区别在于发病部位不同、皮疹分布不同、并发症风险不同、病程长短不同、病原体类型不同。具体分析如下：
1.发病部位不同：疱疹性咽峡炎主要累及咽部和口腔黏膜，表现为咽峡部疱疹或溃疡，而手足口病除口腔外，还会在手、足、臀部等部位出现皮疹。疱疹性咽峡炎的病变范围较局限，通常不扩散至其他皮肤区域，口腔症状更为突出，疼痛感明显，可能影响进食。手足口病的口腔疱疹与疱疹性咽峡炎类似，但伴随四肢远端皮疹是其典型特征。
2.皮疹分布不同：疱疹性咽峡炎的皮疹仅出现在口腔后部，如软腭、悬雍垂周围，形态为小水疱或溃疡。手足口病的皮疹呈多形性，可能为斑丘疹、疱疹或丘疹，主要分布在手掌、足底及臀部，口腔疱疹仅是症状之一。皮疹分布差异是临床鉴别的重要依据，手足口病的皮肤表现更广泛且更具特征性。
3.并发症风险不同：疱疹性咽峡炎多数症状较轻，并发症罕见，极少数可能因高热引发惊厥。手足口病部分病例可能进展为重症，出现脑炎、肺水肿或心肌炎等严重并发症，尤其是特定病原体感染时需密切观察神经系统症状。
4.病程长短不同：疱疹性咽峡炎病程较短，通常3至5天退热，疱疹一周内消退。手足口病病程稍长，发热可持续3至7天，皮疹消退需7至10天，重症病例恢复期更长。病程差异与病情严重程度相关，轻症手足口病与疱疹性咽峡炎恢复时间接近。
5.病原体类型不同：疱疹性咽峡炎主要由特定肠道病毒引起，而手足口病病原体更复杂，包括多种肠道病毒亚型。不同病原体导致临床表现和流行特征差异，部分病毒亚型与重症手足口病密切相关。
发病期间需保持口腔清洁，避免刺激性食物。密切监测体温变化，出现持续高热或精神萎靡及时就医。隔离患者至症状消失，防止交叉感染。加强个人卫生，勤洗手消毒。患病期间多饮水，补充营养以促进恢复。
