支原体衣原体阳性有自愈的可能，但自愈率相对较低。具体分析如下：
支原体和衣原体是介于细菌和病毒之间的微生物。当人体感染支原体、衣原体后，是否能自愈取决于多方面因素。如果感染者自身免疫力较强，在感染后可能通过免疫系统的作用逐渐清除病原体而实现自愈，但这通常需要一定的时间，且并非所有感染者都能如此。
然而，多数情况下，支原体衣原体感染较难自愈。支原体、衣原体可引起呼吸系统、泌尿系统等多部位的感染及炎症反应。如果不及时治疗，可能会导致病情持续进展，引发更严重的症状，如肺炎支原体感染可引起咳嗽、发热等持续不缓解，甚至可导致肺外并发症；衣原体感染可能引起尿道炎、宫颈炎等，经久不愈可造成不孕、异位妊娠等不良后果。
此外，即使部分患者在感染初期症状可能不明显，但随着时间推移，病情可能会加重或出现慢性化。而且，支原体、衣原体感染具有一定的传染性，可通过呼吸道飞沫、性接触等方式传播，若不治疗，容易造成传播和流行。
因此，当发现支原体、衣原体阳性时，不能单纯寄希望于自愈，应及时就医，进行规范的诊断和治疗，根据具体情况选择合适的抗生素等治疗方法，以促进病情康复，减少并发症和后遗症的发生，同时避免传播给他人。
