高危行为后出现症状的时间因病原体不同而有所差异。艾滋病病毒HIV感染通常在2-4周后出现急性期症状，梅毒潜伏期平均3周左右，淋病和非淋菌性尿道炎多在3-10天显现症状，尖锐湿疣潜伏期可达3-8个月。病毒性肝炎潜伏期差异较大，甲肝约15-50天，乙肝则需1-6个月。需注意部分感染如HIV早期可能完全无症状，单纯依靠症状判断不可靠。
不同病原体的生物学特性决定了窗口期长短。HIV感染后病毒需完成逆转录和扩散过程，2-4周时病毒血症达到高峰，可能引发发热、淋巴结肿大等类流感症状。梅毒螺旋体进入人体后需繁殖至一定数量才会引发硬下疳，这个复制过程通常需要3周。细菌性性病如淋病繁殖速度较快，泌尿系统症状出现较早。HPV等病毒潜伏期长与其逃避免疫监视、缓慢复制的特点有关。潜伏期内虽无症状，但部分疾病已具备传染性，这是防控难点。
所有时间判断都需结合具体暴露方式和检测技术。核酸检测能最早发现病原体，抗体检测需等待免疫应答产生。出现症状应立即就医而非自行判断，未出现症状者也建议在窗口期结束后筛查。预防性用药如HIV阻断药需在72小时内使用。记录暴露日期有助于医生判断检测时机，避免过早检测出现假阴性。任何症状都不具有疾病特异性，需实验室确诊。重复检测对窗口期较长的疾病尤为必要，同时要避免过度恐慌，科学随访才是关键。
