三个月宝宝肠炎可能是自身免疫力较差、细菌感染、药物因素引起。
1.自身免疫力较差。三个月的宝宝自身免疫力较差，容易感染外界的病毒微生物，导致肠道出现炎症反应。建议日常生活中应坚持母乳喂养，同时应注意让宝宝多晒太阳，可以适当做一些被动训练，帮助宝宝提供机体免疫力。
2.细菌感染。如果家里的环境卫生较差，宝宝接触后可能会被细菌感染，进而可能会出现肠道炎症。建议日常生活中应注意宝宝的卫生，避免让宝宝接触不洁的东西或者食物。可以在医生的指导下使用阿莫西林克拉维酸钾颗粒、头孢克洛颗粒等药物治疗。
3.药物因素。如果日常生活中盲目自行使用抗生素，可能会导致宝宝肠道菌群失调，进而可能会引起肠炎。建议日常生活中应遵医嘱使用药物，避免自行停药或者加大药量。
除上述原因外，还可能是肠系膜动脉血管狭窄引起，应及时去医院就诊，遵医嘱进行治疗，以免贻误病情。
