正确使用避孕套可以大幅降低性病传播风险，但无法完全杜绝感染可能性。避孕套作为物理屏障能有效阻隔精液、阴道分泌物等含病原体的体液交换，对艾滋病、淋病、衣原体等主要通过体液传播的疾病防护效果显著，研究显示规范使用乳胶避孕套可使HIV传播风险降低约85%。避孕套的防护效果受多种因素影响，并非绝对安全。
避孕套的防护局限性主要来自三方面原因。首先，避孕套仅能覆盖阴茎部位，若病原体通过皮肤接触传播如HPV、疱疹、梅毒等，未覆盖区域的黏膜或皮损仍可能造成感染。其次，使用过程中可能出现滑脱、破裂等意外情况，特别是超薄型避孕套破裂率达1-3%，油性润滑剂会加速乳胶老化。部分性病存在无症状排毒期，感染者可能忽视防护。例如HPV病毒颗粒仅55纳米，能透过避孕套材料微小孔隙，临床统计显示使用避孕套女性感染HPV的风险仍达30-40%。
确保防护效果需注意多个环节。选择标有医疗器械认证的乳胶或聚氨酯避孕套，避免使用过期产品或含N-9杀精剂的类型。全程正确佩戴，佩戴前挤出储精囊空气，性行为结束后立即取下并打结丢弃。高危暴露后72小时内可使用PEP阻断药物，定期进行性病筛查。特别提醒，避孕套对阴虱、疥疮等寄生虫类性病无防护作用，多重防护措施结合安全性行为才能最大限度降低风险。
