紫草在传统医学中有用于治疗扁平疣的记载，但其疗效缺乏现代医学的明确验证。部分民间疗法认为紫草具有抗病毒和促进皮肤修复的作用，可能对由HPV病毒引起的扁平疣有一定辅助效果，但需结合实际情况谨慎使用。
紫草中的活性成分如紫草素，在实验室研究中显示出抗炎和抑制病毒复制的潜力，这可能是其被用于皮肤病症的原因。传统用法常将紫草制成油剂或膏剂外涂，通过局部作用缓解疣体症状。扁平疣的治疗需综合考虑病毒类型、个体免疫状态等因素，单纯依赖紫草可能无法根除病因。现代医学更推荐采用冷冻、激光或免疫调节等规范治疗，紫草仅可作为辅助尝试，且需避免替代主流疗法。
使用紫草时需注意过敏风险，部分人群接触后可能出现皮肤红肿或刺激反应。外用时需避开黏膜和破损皮肤，孕妇及哺乳期女性应避免使用。紫草的制备方法和浓度差异可能影响效果，自行调配存在不确定性。若疣体持续增大、扩散或伴随疼痛，应及时就医，避免延误治疗。紫草与某些药物可能产生相互作用，长期使用需咨询专业医师意见。
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