婴儿出生时阴茎短小是否正常需结合具体情况判断。多数情况下，新生儿阴茎外观短小属于正常生理现象，可能与阴茎埋藏于皮下脂肪或发育阶段差异有关。但若伴随尿道下裂、隐睾等异常体征，或阴茎长度明显低于同龄标准足月儿＜2.5cm，则需警惕先天性发育异常的可能。
新生儿阴茎长度的测量需采用标准化方法：从耻骨联合处按压脂肪层至阴茎根部，充分伸展后测量阴茎头至根部的距离。亚洲足月男婴平均出生时阴茎伸展长度为3.5±0.7cm，若低于2.5cm可定义为小阴茎，需进一步检查下丘脑-垂体-性腺轴功能。常见原因包括促性腺激素分泌不足、雄激素受体异常或特发性发育迟缓。部分案例中，阴茎短小可能合并染色体异常如Klinefelter综合征或先天性垂体功能减退。早产儿因发育未成熟，阴茎尺寸通常较小，需按矫正月龄评估。
观察期间应避免过度拉扯或刺激婴儿生殖器。母乳喂养有助于促进下丘脑功能发育，6个月后若仍明显短小需内分泌科就诊。诊断流程包括染色体核型分析、血清睾酮和促黄体生成素检测，必要时进行垂体MRI。激素替代治疗需严格掌握指征，2岁前慎用雄激素以免影响骨龄。家长需记录阴茎生长曲线，同时关注有无排尿异常或睾丸未降等伴随症状。部分隐匿性阴茎案例可通过整形手术矫正，但真性小阴茎需多学科协作制定长期管理方案。
