肛门上边和阴囊下面疼可能是由肛周疾病、泌尿系统疾病、生殖系统疾病、局部外伤、神经性疼痛等原因引起的。具体分析如下：
1.肛周疾病：肛周脓肿、肛瘘等肛周疾病可能会引起肛门上边疼痛，炎症可能波及阴囊下方附近区域。肛周脓肿多由肛腺感染引起，细菌在肛周软组织内滋生繁殖，形成脓肿，表现为局部红肿热痛。肛瘘则是肛周脓肿破溃后形成的慢性炎性管道，常有分泌物溢出，刺激周围组织产生疼痛。对于肛周脓肿，初期可采用抗生素治疗，如头孢类抗生素，脓肿形成后多需要手术切开引流。肛瘘一般需要手术切除瘘管才能治愈。
2.泌尿系统疾病：膀胱炎、尿道炎等泌尿系统感染，或者膀胱结石、尿道结石等也可能导致阴囊下及肛门附近疼痛。泌尿系统感染时，细菌侵袭尿路黏膜，引起炎症反应，炎症刺激周围神经可导致疼痛放射到阴囊下方和肛门上边区域。膀胱结石或尿道结石在移动过程中，可能损伤尿路黏膜，或者引起尿路梗阻，导致疼痛。对于泌尿系统感染，需要根据感染的细菌类型选择合适的抗生素，如喹诺酮类抗生素。对于结石，较小的结石可通过多饮水、多运动促进排出，较大的结石可能需要体外冲击波碎石或手术取石。
3.生殖系统疾病：附睾炎、精索静脉曲张等生殖系统疾病可能引起阴囊下面疼痛，疼痛有时会放射到肛门上边。附睾炎多由细菌感染引起，常见的细菌如大肠杆菌等，炎症可导致附睾肿胀、疼痛。精索静脉曲张是指精索内蔓状静脉丛的异常伸长、扩张和迂曲，可引起阴囊坠胀、疼痛，久站或行走后加重。附睾炎需要使用抗生素治疗，同时要卧床休息，抬高阴囊。精索静脉曲张症状较轻时可穿紧身内裤托起阴囊，症状严重者可能需要手术治疗。
4.局部外伤：该部位受到外力撞击、挤压等外伤时，会出现疼痛。比如在运动过程中不慎碰撞到硬物，或者遭受暴力打击等。局部软组织损伤后会出现淤血、肿胀，进而引起疼痛。对于轻度的外伤，受伤初期可进行冷敷，减少局部出血和肿胀，后期可热敷促进血液循环，帮助恢复。如果外伤严重，出现骨折或脏器损伤等情况，需要及时就医进行相应的处理。
5.神经性疼痛：如坐骨神经痛、会阴部神经痛等可能导致该部位疼痛。坐骨神经痛可能是由于腰椎间盘突出症压迫坐骨神经引起，也可能是坐骨神经本身的炎症等原因。会阴部神经痛可能与神经受压、神经炎症等有关。疼痛多为刺痛、灼痛或放射性疼痛。对于神经性疼痛，需要针对病因进行治疗，如腰椎间盘突出症引起的坐骨神经痛，可先采取保守治疗，如卧床休息、牵引、物理治疗等，严重时可能需要手术治疗。
如果出现肛门上边和阴囊下面疼痛的情况，应及时就医，通过详细的检查，如体格检查、实验室检查、影像学检查等，明确病因，然后进行针对性的治疗。
