前列腺检查的疼痛感因人而异，但多数情况下属于轻度不适，而非剧烈疼痛。检查过程中可能伴随短暂胀痛或压迫感，尤其是进行肛门指检或前列腺按摩时，敏感人群会有较强不适，但通常可以耐受。现代医疗手段已极大降低检查的创伤性，多数人反馈疼痛程度类似抽血或肌肉注射。
前列腺检查主要包括肛门指检、超声检查经腹部或直肠和前列腺液取样。肛门指检由医生戴手套涂抹润滑剂后伸入直肠触诊，主要不适源于肛门括约肌的牵拉和前列腺的按压，整个过程约10-20秒。经直肠超声需将探头置入直肠，直径约1.5-2cm的探头可能造成胀满感，但会提前使用局部麻醉凝胶。前列腺液取样通过按摩前列腺获取分泌物，敏感者可能出现类似排尿灼痛的短暂刺激。部分医疗机构提供无痛检查方案，如口服镇痛药或肛门局部麻醉。
检查前需排空肠道减少不适，有痔疮急性发作或肛裂应提前告知医生。检查后可能出现肛门隐痛或轻微血丝，通常1-2天自行缓解。凝血功能障碍或服用抗凝药物者需评估出血风险。检查后24小时内避免骑车或久坐，以防前列腺充血。若出现持续剧痛、发热或大量出血需立即就医。选择经验丰富的医师操作能显著降低不适感，检查时采用腹式呼吸有助于放松肌肉。部分人群因紧张会放大痛觉，检查前与医生充分沟通可缓解焦虑。
