阴茎上有小丘疹可能是珍珠状阴茎丘疹、尖锐湿疣、包皮龟头炎、皮脂腺异位症、过敏反应等原因导致的。具体分析如下：
1.珍珠状阴茎丘疹：珍珠状阴茎丘疹可能与局部刺激、生理发育变异等有关。主要表现为阴茎冠状沟处环绕龟头出现的淡红色小丘疹，多互不融合。一般无自觉症状，不影响健康，通常不需要特殊处理，注意局部清洁卫生，避免过度刺激即可。
2.尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒HPV感染引起的性传播疾病。多通过性接触传播，也可通过间接接触传播。病变初期为单个或多个散在的淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后期可融合成菜花样、鸡冠样等外观。需要及时就医，可通过外用药物如鬼臼毒素等、物理治疗如冷冻、激光等或手术切除等方法去除疣体，同时性伴侣需同时检查和治疗。
3.包皮龟头炎：包皮过长或包茎、局部清洁不到位、细菌或真菌感染等都可能引发包皮龟头炎。炎症刺激可导致阴茎上出现小丘疹，还可伴有红肿、疼痛、瘙痒等症状。若是细菌感染，可使用抗生素药膏如莫匹罗星软膏等；若是真菌感染，则使用抗真菌药物如克霉唑乳膏等，同时要保持局部清洁，必要时行包皮环切术。
4.皮脂腺异位症：皮脂腺异位症病因尚不明确，可能与内分泌因素、局部刺激等有关。表现为阴茎皮肤上孤立的、针头大小的黄白色小丘疹，多无自觉症状。一般不需要治疗，若患者有强烈治疗需求，可通过激光等方法去除。
5.过敏反应：接触某些物质如避孕套、清洁剂、新换的内裤材质等可能引起过敏反应。阴茎上可出现小丘疹，常伴有瘙痒、红肿等症状。要及时脱离过敏原，可口服抗组胺药物如氯雷他定片等，局部可使用糖皮质激素药膏如氢化可的松乳膏等缓解症状。
如果发现阴茎上有小丘疹，不要自行盲目判断或用药，应及时就医，通过详细的检查明确病因，以便进行针对性的治疗。
