使君子对痤疮可能有一定辅助作用，但并非主流治疗方法。传统中医认为使君子具有清热解毒、杀虫消积的功效，而痤疮的形成与湿热、血热等因素相关，因此使君子可能通过调节体内湿热状态间接改善痤疮症状。不过现代医学治疗痤疮主要依赖维A酸、抗生素等药物，使君子的疗效尚未得到充分临床验证。
使君子作为一味中药材，其活性成分如使君子酸钾被认为具有抗炎和抑菌作用。痤疮的发病机制与痤疮丙酸杆菌感染、毛囊角化异常密切相关，理论上使君子可能通过抑制细菌生长或调节皮脂分泌发挥作用。部分民间验方会将使君子与其他草药配伍外敷，但具体效果因人而异。使君子含有少量毒性成分，超量使用可能导致恶心、腹痛等不良反应，内服时需严格遵循医嘱。新鲜使君子果仁更需谨慎处理，避免引发呃逆等副作用。
使用使君子治疗痤疮时，应先咨询中医师进行体质辨证。孕妇、体虚者及过敏体质人群应禁用。外敷可能出现皮肤刺激反应，建议先小范围试用。治疗期间需配合清淡饮食，避免辛辣油腻食物。若痤疮伴有严重感染或囊肿结节，应及时就医采用抗生素或光动力等现代疗法，不可单纯依赖中药。使君子与其他西药同服时可能存在相互作用，需间隔两小时以上服用。保存时应置于阴凉干燥处，防止霉变影响药效。
