水翁花在适宜条件下可以储存12-18个月。干燥、避光、密封的环境能最大限度保留有效成分，新鲜水翁花冷藏仅能维持3-5天，而经过专业干燥处理的花材保质期显著延长。储存时长受原料品质、加工工艺和保存方式多重因素影响。
水翁花作为传统药用植物，其储存稳定性与活性成分密切相关。花蕾采摘后需立即进行杀青处理，高温快速破坏氧化酶可防止褐变。专业干燥采用40℃以下低温慢烘，既能脱去水分又可避免挥发油损失。真空包装配合脱氧剂能将黄酮类物质保留率提升至85%以上。家庭储存建议使用深色玻璃罐，置于阴凉处并放入食品级干燥剂，定期检查有无受潮结块现象。工业级仓储需控制环境湿度在45%以下，温度不超过25℃，定期抽样检测微生物含量。
储存过程中需警惕霉变风险，受潮后产生的黄曲霉素具有强致癌性。颜色发暗、出现异味的花材必须废弃。避免与气味浓烈的物品同放，水翁花易吸附异味导致药效改变。孕妇及过敏体质者使用前需确认储存期限，过期花材可能引发不良反应。实验室超过24个月的陈花其抗菌活性下降37%，不建议继续入药。商业流通环节需严格执行先进先出原则，包装袋应标注灭菌日期和批次编号。
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