药物流产本身不会直接导致输卵管堵塞。药流通过药物作用促使子宫收缩排出胚胎，主要影响子宫内环境，与输卵管结构无直接关联。输卵管堵塞通常由感染、炎症或手术创伤等因素引发，与药流操作无明确因果关系。
输卵管堵塞多与盆腔炎症性疾病PID相关，尤其是衣原体或淋球菌感染。若药流后护理不当，如过早同房、卫生不良或未遵医嘱使用抗生素，可能增加上行感染风险，间接引发输卵管炎或粘连。药流不完全导致宫腔残留时，可能需清宫手术，此类侵入性操作可能带来感染或创伤，进而影响输卵管通畅性。
药流后需严格遵循医学指导，包括按时复诊确认流产效果，避免两周内同房及盆浴，以防细菌侵入。出现发热、持续腹痛或异常分泌物时需及时就医，排查感染。有盆腔炎病史或多次流产史者更需谨慎，必要时通过超声或输卵管造影评估生殖系统状况。科学避孕和规范操作是降低远期并发症的关键。
