乙脑和AC流脑的区别有病原体不同、病变类型不同、传播途径不同、发病季节不同。
1.病原体不同。乙脑的病原体主要寄生在中枢神经系统。而AC流脑的病原体是细菌，即脑膜炎双球菌，而乙脑的病原体是病毒，叫做乙型脑炎病毒，寄生的部位也是不同的，AC流脑病毒的寄生部位主要寄生在病人的鼻咽部。
2.病变类型不同。乙脑是因为乙型脑炎病毒感染人体引起的一种以脑实质发生变质性炎症，为主要病变的一种急性中枢神经系统疾病。而AC流脑是因为脑膜炎奈瑟菌感染人体引起的一种急性化脓性脑膜炎。
3.传播途径不同。乙脑通常是由乙脑病毒引起的急性传染病，一般通过蚊子叮咬传播，AC流脑是由脑膜炎球菌感染引起，传播途径一般是通过呼吸道，病原菌从鼻咽侵入血液循环系统形成菌血症。
4.发病季节不同。乙脑主要是通过蚊子叮咬引起，所以高发于7、8、9三个月间。而AC流脑主要是通过空气飞沫经呼吸道感染引起，所以高发于冬、春两季。
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