细菌性红眼病指急性细菌性结膜炎，病毒性红眼病指病毒性结膜炎，这两者的区别是病原体不同、使用药物不同、病情持续时间不同、自愈性不同、并发症不同等。具体分析如下：
1.病原体不同。急性细菌性结膜炎通常是由金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌等细菌感染结膜所引起的疾病。病毒性结膜炎通常是由病毒感染引起的结膜炎症，比如腺病毒、A24型柯萨奇病毒、单纯疱疹病毒等，所以这两种疾病的致病菌不同。
2.使用药物不同。患有急性细菌性结膜炎后，需要在医生指导下使用抗生素药物治疗，常见的药物有加替沙星滴眼液、盐酸左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等，用药后能够起到抗菌消炎的作用。如果是病毒性结膜炎需要在医生指导下使用抗病毒的药物治疗，比如更昔洛韦滴眼液、利巴韦林滴眼液、阿昔洛韦滴眼液等药物治疗。
3.病情持续时间不同。病毒性结膜炎持续的时间比较短，病情发展的比较迅速。而急性细菌性结膜炎持续的时间相对比较长，如果没有及时治疗，还会加大治疗疾病的难度。
4.自愈性不同。正常情况下，病毒性结膜炎有一定的自限性，一般在患病的7~10天疾病会自行痊愈。急性细菌性结膜炎并不存在自限性，所以患病后需要积极配合医生治疗，避免延误治疗时间，诱发病情加重。
5.并发症不同。患有急性细菌性结膜炎后可能会诱发角膜穿孔，而且炎症还具有蔓延性，容易增加患脑膜炎、肺炎、败血症等其他疾病的患病概率。大部分病毒性结膜炎不会出现并发症，只有少部分患者会形成角膜瘢痕，导致视力下降。
不管患有哪种疾病，患病后均需要就医，积极配合医生治疗，在治疗期间还应做好眼部护理，禁止疲劳用药，保持充足睡眠，有利于病情的恢复。
