海金沙具有一定的化石排石作用，可用于辅助治疗泌尿系统结石。作为传统中药材，海金沙在《本草纲目》等典籍中被记载能通利小肠，治湿热肿满，现代研究也发现其含有的黄酮类成分可抑制结石结晶形成，促进小结石排出。但需明确其作用有限，无法替代现代医学的碎石或手术取石等主要治疗手段。
海金沙的排石机制主要体现在三个方面，所含的硅酸盐成分能改变尿液pH值，抑制草酸钙结晶聚集；黄酮类物质可松弛输尿管平滑肌，缓解结石移动时的绞痛；多糖成分具有利尿作用，能增加尿量冲刷泌尿道。临床观察显示，对于直径小于0.6厘米的光滑结石，配合大量饮水及运动，海金沙煎剂可提升33%-45%的自主排石率。但需注意，结石成分若为磷酸盐或胱氨酸型，海金沙效果明显减弱。动物实验还发现，其醇提取物能降低肾脏草酸钙沉积量达27%。
使用海金沙需严格辨证施治。肾阳虚衰引起的虚性结石禁用，误用可能导致肾功能损伤。服药期间每日饮水量需保持2000ml以上，同时限制高草酸食物摄入。B超监测必不可少，若结石超过4周未排出或出现血尿、发热，需立即停用并就医。孕妇及肾功能不全者避免使用，与抗生素联用可能降低药效。药材需选择孢子完整、棕黄色的正品，伪品可能含重金属。现代医学建议，直径超过0.8cm的结石或伴有肾积水者，应优先考虑体外冲击波碎石术。
