新型隐球菌脑膜炎的有效治愈需要综合抗真菌治疗、对症支持及严密监测。早期诊断和规范用药是关键，两性霉素B联合氟胞嘧啶是首选方案，后续可改用氟康唑维持治疗。及时干预可显著提高治愈率，降低病死率和后遗症风险。
治疗新型隐球菌脑膜炎需分阶段进行。诱导期使用两性霉素B静脉给药，联合氟胞嘧啶口服，疗程至少4周，以快速杀灭病原体。两性霉素B需逐步加量至目标剂量，注意监测肾功能和电解质。巩固期改用氟康唑口服，持续8周以上，确保彻底清除真菌。颅内压增高者需频繁腰穿放脑脊液或留置引流管，必要时加用甘露醇脱水。免疫抑制患者需调整基础疾病治疗，HIV感染者应尽早启动抗病毒治疗。辅助治疗包括营养支持、纠正水电解质紊乱及预防药物不良反应。
治疗期间需警惕两性霉素B的肾毒性，定期检测血肌酐和尿素氮。氟胞嘧啶可能引起骨髓抑制，需每周复查血常规。腰穿测压应每1-2日进行，保持脑脊液压力低于200mmH₂O。HIV患者免疫重建炎症综合征可能加重症状，需暂时加大激素用量。疗程结束后仍需每3个月复查脑脊液，持续监测1年。避免擅自停药或减量，防止复发。妊娠期患者禁用氟胞嘧啶，需调整用药方案。治疗失败或复发者需进行药敏试验，考虑替换为伏立康唑或伊曲康唑。
