治疗慢性浅表性胃炎并没有一种绝对的良效药，因为不同患者的病情、病因和身体状况有所差异，不过有一些药物在治疗中较为常用且效果较好，比如质子泵抑制剂。
质子泵抑制剂能够有效抑制胃酸分泌，减少胃酸对胃黏膜的刺激。像奥美拉唑、兰索拉唑等药物，通过作用于胃壁细胞上的质子泵，从而阻断胃酸分泌的最后步骤。对于慢性浅表性胃炎患者中胃酸分泌过多而导致胃痛、烧心等症状有很好的缓解作用。胃黏膜保护剂也是常用药物，例如铝碳酸镁，可以在胃黏膜表面形成一层保护膜，阻止胃酸、胃蛋白酶以及胆汁等对胃黏膜的损伤，促进胃黏膜的修复。如果慢性浅表性胃炎患者伴有幽门螺杆菌感染，还需要进行幽门螺杆菌的根除治疗，通常采用质子泵抑制剂、铋剂和两种抗生素联合使用的方案，抗生素如阿莫西林、克拉霉素等。
在使用这些药物治疗慢性浅表性胃炎时也有一些注意事项。首先，药物的使用应该在医生的指导下进行，不能自行增减药量或者停药。例如质子泵抑制剂如果长期大量使用可能会有一些不良反应，像影响钙吸收等。胃黏膜保护剂可能会影响其他药物的吸收，所以如果同时服用多种药物时要注意间隔时间。对于进行幽门螺杆菌根除治疗的患者，要严格按疗程用药，避免治疗不彻底导致幽门螺杆菌耐药，增加后续治疗的难度。同时，患者在治疗期间还应注意饮食规律，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物等，以促进病情的恢复。
