氟康唑可以用于治疗部分类型的阴道炎，尤其是由念珠菌感染引起的霉菌性阴道炎。作为广谱抗真菌药物，氟康唑通过抑制真菌细胞膜合成发挥杀菌作用，对白色念珠菌等常见致病菌有显著效果。但需注意，阴道炎的病因多样，并非所有类型都适用氟康唑治疗。
氟康唑治疗念珠菌性阴道炎通常采用口服或局部用药方式。单次口服150mg氟康唑的疗效与局部使用抗真菌阴道栓剂相当，适合不愿接受局部给药的患者。对于复发性感染，可能需要每周一次、连续6个月的维持疗法。临床氟康唑对急性念珠菌阴道炎治愈率达85%-90%，但对非白色念珠菌属如光滑念珠菌的效果可能较差。细菌性阴道病和滴虫性阴道炎则需选择甲硝唑等抗菌药物，使用氟康唑不仅无效还可能破坏正常菌群。因此用药前必须通过显微镜检查或培养明确病原体类型。
使用氟康唑需警惕药物相互作用和不良反应。与华法林合用可能增加出血风险，与磺脲类降糖药联用易引发低血糖。常见副作用包括头痛、消化道不适，偶见肝酶升高。妊娠期尤其前三个月禁用口服制剂，哺乳期妇女用药期间应暂停母乳喂养。肝功能异常者需调整剂量，用药期间建议监测肝功能。对唑类药物过敏者禁用，用药后出现皮疹等过敏反应需立即停药。治疗期间应避免性接触或要求伴侣同步治疗，防止交叉感染。完成疗程后若症状未缓解，需重新评估诊断而非自行延长用药。
