十二指肠闭锁有可能会被误诊。
在临床上，十二指肠闭锁的诊断存在一定挑战，可能导致误诊情况的发生。从症状方面来看，十二指肠闭锁的典型表现是新生儿出生后不久即出现呕吐，且呕吐物多含有胆汁。其他一些疾病也可能有类似的呕吐症状，例如先天性肥厚性幽门狭窄，这种疾病也多见于新生儿，同样以呕吐为主要表现，但呕吐物多为不含胆汁的奶液。如果医生在诊断时仅关注呕吐这一症状，而没有深入探究呕吐物的性状、结合其他检查结果综合判断，就可能将十二指肠闭锁误诊为先天性肥厚性幽门狭窄。
从检查手段的局限性来说，产前超声检查是发现胎儿异常的重要手段，但十二指肠闭锁在超声下的表现可能并不十分典型。比如，胎儿体位不佳时，可能影响超声对十二指肠区域的清晰观察，导致无法准确判断十二指肠是否存在闭锁情况。而且，超声图像的解读具有一定主观性，不同经验水平的超声医生可能得出不同的结论。在产后诊断时，X线检查虽然有助于发现十二指肠闭锁的一些特征，如典型的双泡征，但如果肠道内气体分布受到其他因素干扰，或者对X线影像特征认识不足，也可能造成误诊。同时，一些复杂的合并症也会增加诊断的难度，例如当十二指肠闭锁合并其他先天性消化道畸形时，多种异常表现交织在一起，容易混淆诊断方向，从而导致误诊。
