TCT检查通常不会引起明显疼痛，多数人仅会感到轻微不适。这项检查使用软毛刷或刮片轻轻刮取宫颈细胞，过程快速且操作轻柔，疼痛感因人而异，但普遍属于可耐受范围。敏感体质或宫颈存在炎症时可能出现短暂酸胀感，但持续时间很短。
检查过程中，医生会使用阴道窥器暴露宫颈，可能带来少许压迫感。取样工具接触宫颈时，部分人会有类似月经期的下腹坠胀，这种不适在取样结束后立即消失。实际感受与个人疼痛阈值、宫颈状态密切相关，未生育女性可能比经产妇更敏感些。现代TCT采用改良的取样器，相比传统宫颈刮片疼痛度已显著降低，绝大多数受检者描述为有点别扭但能忍受。
检查前应避开月经期，最佳时间为月经干净后3-7天。检查前24小时避免性生活、阴道灌洗或使用栓剂，以免影响结果准确性。有严重阴道炎或急性盆腔炎需治愈后再检查。检查后可能出现极少量血性分泌物，属正常现象，但若出血量多于月经或持续超过三天需就医。妊娠期女性需告知医生，必要时推迟检查。精神过度紧张可能放大不适感，检查前深呼吸放松能有效缓解紧张情绪。医疗机构现在多采用一次性无菌器材，交叉感染风险极低，无需过度担忧。
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