隐睾症主要和以下几个疾病鉴别：

　　(1)无睾丸，阴囊发育不良，空虚无睾丸，无生殖能力，第二性征差，呈宦官型发育，皮下脂肪丰满，皮肤细，音调高，胡须、阴毛稀少，喉结不明显，腹部B超及手术探查均无睾丸存在。分为单侧睾丸缺如和双侧睾丸缺如。

　　①单侧睾丸缺如，称单睾症，较为少见，有资料报道，在男性中约占1/5000，因性腺未发育或在妊娠早期胎儿睾丸发生扭转，血管栓塞而退化。如在手术探查中可以找到附睾、输精管及精索封闭呈盲端，不见睾丸。

　　②双侧睾丸缺如，称无睾症，较为罕见，有资料报道，在男性中约占1/20000，因睾丸发生退化消失所致。检查卵泡刺激素(FSH)及黄体生成素(LH)增高，注射绒毛膜促性腺激素(HCG)后，睾酮不增高。

　　(2)睾丸回缩，阴囊发育良好，以手沿腹股沟向下推送时，睾丸可被轻轻推入阴囊。亦可由于提睾肌反射或寒冷刺激，睾丸可同缩至腹股沟，阴囊内扪不到睾丸，但待腹部温暖或局部热熨，睾丸可复出。

　　(3)腹股沟淋巴结，常与位于腹股沟部的隐睾相似，但淋巴结为豆形，质地较硬，大小不一，且数目较多，不活动，阴囊内睾丸存在。

　　(4)男性假两性畸形，常合并有隐睾，且有尿道下裂，阴囊分裂似女性外阴等生殖器官的严重畸形。但性染色体检查为XY，B超及手术探查可发现睾丸。