卵巢囊肿的治疗方法可以分以下几种：

1.如果是排卵形成的生理性囊肿，可以自行吸收或者消失，需要定期复查即可，不需要特殊处理。

2.如果为生长迅速的囊肿，需要警惕发生恶变的风险，要及早进行手术切除。

3.如果因畸胎瘤等容易发生蒂扭转、破裂等造成剧烈腹痛等现象，所以应在医生指导下选择适合的治疗方案。

如果囊肿达到5cm以上，最好行腹腔镜下卵巢囊肿剥除术，这样不影响卵巢正常功能。手术后要组织活检，并且手术后要及时收缩子宫消炎治疗。