肛瘘的主要治疗方法是手术治疗，手术后需要进行坐浴，每次坐浴的时间在10~20分钟之间。

肛瘘手术后进行肛门熏洗、坐浴，除了有清洁肛门的作用外，还具有治疗作用，坐浴的温水中可以加入具有消炎作用的高锰酸钾，也可以加入具有清热燥湿、消肿止痛作用的中草药。对肛瘘伤口具有消炎、消肿、促进愈合的作用，有利于肛瘘恢复。

坐浴前排空大小便，将40℃左右的温热水置于盆内，将药液放入盆内的温水中，先利用药物热气在肛门部熏，等药液温度适宜时可将臀部浸没于水中，进行肛门熏洗坐浴，每次坐浴10~20分钟，每天坐浴2~3次。