先天性肛门畸形是有可能会导致肛门狭窄的。

先天性肛门畸形属于常见的儿童消化道畸形，主要是由于肛门和直肠部位发育出现异常从而导致肛门狭窄。引起肛门狭窄的原因有很多，肛门和肛管部位的炎症形成瘢痕，引起肛门痉挛、收缩、粘连，也可诱发肛门狭窄。肛门局部做了手术，比如痔疮手术、肛瘘手术和肛周脓肿手术后形成瘢痕组织，也可以引起肛门狭窄。

因此，先天性肛门畸形是有可能会导致肛门狭窄，一旦发生此种情况，需要积极做手术治疗，改善肛门狭窄。