有几种原因一个是你月经周期比较长，排卵晚受精晚所以导致看不到孕囊。比如说一般人平常28天或者一个月左右来一次月经，你可能是40天来一次月经。所以有时候排卵，排卵晚受精晚看不到孕囊。还有一种情况就是本身胚胎发育不好有可能不排除生化了胚胎停育了，所以看不到孕囊。还有一种特殊的情况就是有可能是宫外孕，宫外孕是这个孕卵着床于子宫腔以外。然后慢慢会出现明显的肚子疼，如果疼痛剧烈的话有可能会出现盆腔积血，然后出现休克的症状。所以出现就是怀孕41天看不到孕囊的情况不排除以上的几种原因，所以通过定期的b超检测再就是抽血化验一下hcg和孕酮结合你的临床症状，比如说有没有明显的肚子疼阴道流血，结合hcg变化情况以及b超综合判断排除宫外孕。排除这个生化、胚胎停育。然后看看胚胎到底发育怎么样有没有胎心胎芽，所以及时的处理比较重要的。综上所述怀孕41天看不到孕囊，主要就是一个是排卵卵受精晚。孕囊比较小，所以看不到再一个就是不排除胚胎停育、生化妊娠发育不好了。另一个不排除宫外孕，需要综合判断来综合的做出这个处理的意见的以确保母婴安全。