3个月的宝宝拉肚子要及时前往医院化验大便常规，查找原因，给予止泻治疗。

如果孩子的精神状态比较好，大便次数不多，没有脱水症状，只是由于消化不良引发的拉肚子，可以给予蒙脱石散、布拉氏酵母菌、四磨汤口服液等药物综合治疗，一般很快能得到明显改善。

如果确诊是细菌感染引起的，需要在医生的指导下服用头孢类或青霉素类的抗生素，控制炎症。对于比较小的宝宝，因为水电解质调节能力较差，可以口服补液盐，补充体内的液体，防止脱水。如果严重时，还需要静脉点滴输液治疗。