女性右侧附件囊肿的治疗，首先要看检查的时间、囊肿的大小以及是否伴有症状进行处理。

如果是排卵期以后发现附件囊肿，而且大小只有2~3cm，大多是生理性的黄素囊肿，一般在月经来过以后就会消失，可以在月经一干净以后再复查。

如果月经干净以后仍然发现有囊肿，而且范围小于5cm，可以继续观察，因为小的囊肿在女性体内一般没有临床症状。但是如果囊肿比较大，超过5cm，而且有的女性会感觉到一侧小肚子胀痛这样的现象，就需要进行手术治疗。