​睾丸大，阴茎短的原因可能是生理性的，也有可能是疾病因素所致。

生理情况常见于个体差异，不同个体或者是同一个体的睾丸大小，以及阴茎长短都不完全相同，存在一定的大小差异。另一种原因是疾病所致，睾丸体积的增大可能是感染后的炎性肿大，也不排除睾丸肿瘤性病变后，而有的睾丸体积较大。

阴茎短小可能跟发育畸形异常有关，需要就诊后临床直观查看，测量数据经线值，采血做性激素以及染色体等相关检查。一旦是过度短小，影响性交，可以根据个体情况，必要时做阴茎延长手术治疗处理。