睾丸萎缩会引起阴茎短小，疾病原因导致睾丸形态萎缩，会影响性激素分泌，导致个体血液性激素水平低下，阴茎海绵体供血量减少，阴茎外观即可呈现为短小外观。

个体性器官以及性腺体发育畸形异常或者是缺失，也是阴茎短小的常见原因之一。最好是就诊后临床对阴茎外观直观查看，门诊检查睾丸，再结合辅助检查，做阴囊彩超了解睾丸质地以及测量经线大小，采血做性激素水平化验。

结合相关检查结果，明确睾丸萎缩以及阴茎短小的具体病因，再针对性的给以药物或者是矫形手术处理。